重庆市中医药学会成立于1952年。学会坚持以奉献、团结、奋进、实干为宗旨，以学术研究交流、科学研究普及、人才培养教育、服务基层大众为已任。重庆直辖后已历经五届理事会。本届理理会正、副会长6名、正副秘书长4名、常务理事46名、理事159名、会员4000余名。学会有46个专业委员会、团体会员57个、专家门诊部1个，是重庆市最具权威的中医药学术团体。

重庆市中医药学会走过了68年光辉历程。1955年由学会校注的《新辑宋本伤寒论》在全国有很大的影响。1956年首届理事吴棹仙于全国政协会议期间向毛主席敬献“子午流注环周图”，在全国医药卫生界传为佳话。2010年以来，学会举办的“国医名师大讲堂”，至今已办十四届，成为学会的品牌学术项目。国医大师郭子光、张学文、王琦、郑新、段亚亭及全国名中医王辉武、张西俭、郭剑华、陈宝贵、孙树椿、蔡淦等知名中医专家70余人在大讲堂讲学，全市近5000名中医药人员参加并学习。连续举办了五届“博硕士论坛”取得满意成果。每年举办大型学术活动50余场次，近6000余人参加学习交流。学会曾获多项学术及科研成果奖。近十年来开展了“中医中药中国行”、“特色中医巴渝行”、“中医药健康服务行”、“走近科技•缤纷节日”等大型中医专家义诊咨询服务及中医药科普文化宣传活动深受广大群众好评。学会连年工作目标考核获特等奖，每年被市科协评为先进集体，曾被授予重庆市“三星级学会”、“5A”级学会、“先进集体标兵学会”。全国中医药先进地方学会、全国“先进集体标兵学会”称号。